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《CHIMA》:CPU也能加速AI?看匯醫慧影醫學影像系統的實戰收獲

文章來源:匯醫慧影

15/09

2021

轉自CHIMA
本文英特爾供稿



利用AI技(ji)術(shu)加快醫(yi)學影(ying)像(xiang)(xiang)分析速度,支持醫(yi)療機(ji)構完成從信息化(hua)向智(zhi)能(neng)化(hua)的轉型(xing),讓更多(duo)病患從智(zhi)慧醫(yi)療技(ji)術(shu)的發展(zhan)中獲(huo)益(yi),是匯(hui)醫(yi)慧影(ying)一直以來的目標和(he)愿景。通過引入第二代英特(te)爾?至強?可擴展(zhan)處理器、OpenVINO?工具(ju)套件(jian)以及面向英特(te)爾?架(jia)構優化(hua)的Python等領先軟硬(ying)件(jian)產品(pin)和(he)技(ji)術(shu),使我們醫(yi)學影(ying)像(xiang)(xiang)解決(jue)方案的各個平(ping)臺的處理效率(lv)都獲(huo)得了(le)顯著提升。
                   ;                                                           ——匯醫慧影CEO&創始人(ren) 柴象飛

盡管有多種多樣的(de)檢(jian)測(ce)方(fang)式,但CT影(ying)像依然是(shi)新(xin)冠檢(jian)測(ce)中更有效的(de)判(pan)斷依據。為了助力更加快速和(he)精準地處理海量的(de)(de)影(ying)像數據,匯醫慧(hui)影(ying)在英特爾軟硬(ying)件組(zu)合拳(quan)的(de)(de)幫助下(xia),全面提升其全周期AI醫學(xue)影(ying)像解(jie)決方(fang)案的(de)(de)性能,在新型冠狀病(bing)毒(du)肺炎篩(shai)查、乳(ru)腺癌檢測等多場景(jing)應用中都成效(xiao)顯著。

從2019年年底開(kai)始迅速擴散的(de)(de)新(xin)型冠狀病毒肺(fei)炎(yan)(COVID-19,以下簡稱“新(xin)冠肺(fei)炎(yan)”)疫(yi)情,對醫(yi)(yi)療(liao)機構的(de)(de)快(kuai)速診斷(duan)能(neng)(neng)力提出了突(tu)如(ru)其來且非常嚴峻的(de)(de)挑戰(zhan),利用人工(gong)智(zhi)能(neng)(neng)(ArtificialIntelligence,以下簡稱AI)方(fang)(fang)法開(kai)展(zhan)醫(yi)(yi)學(xue)影像(xiang)(xiang)智(zhi)能(neng)(neng)分析(xi)及(ji)輔助診斷(duan),是應對這(zhe)一(yi)挑戰(zhan)的(de)(de)有效方(fang)(fang)案(an)。一(yi)直致力于(yu)計算機視覺和深度學(xue)習技術(shu)應用開(kai)發的(de)(de)匯(hui)醫(yi)(yi)慧影,就通(tong)過其自主研發的(de)(de)Dr.TuringAI平(ping)臺、Radcloud大(da)數(shu)(shu)據智(zhi)能(neng)(neng)分析(xi)云(yun)平(ping)臺以及(ji)Novacloud智(zhi)慧影像(xiang)(xiang)云(yun)等(deng)產(chan)品,為(wei)眾多醫(yi)(yi)療(liao)機構提供了一(yi)套(tao)全周(zhou)期、高(gao)性能(neng)(neng)的(de)(de)AI醫(yi)(yi)學(xue)影像(xiang)(xiang)解決方(fang)(fang)案(an),并將(jiang)其成功應用于(yu)包括新(xin)冠肺(fei)炎(yan)在內的(de)(de)數(shu)(shu)十種(zhong)疾(ji)病的(de)(de)診療(liao)。

作為該方案中專攻醫(yi)(yi)(yi)學影像(xiang)輔助(zhu)診斷的(de)前端先鋒(feng),Dr.TuringAI平臺可為醫(yi)(yi)(yi)院(yuan)和患(huan)者提(ti)供(gong)10余種常見疾病的(de)醫(yi)(yi)(yi)學影像(xiang)AI分析(xi)能力,并提(ti)供(gong)結構化(hua)的(de)報告;Novacloud智慧影像(xiang)云(yun)可通過基于云(yun)服務的(de)端到端AI互動能力,為醫(yi)(yi)(yi)、患(huan)和醫(yi)(yi)(yi)院(yuan)的(de)管理(li)者提(ti)供(gong)更為便捷(jie)的(de)服務;Radcloud大數據智能分析(xi)云(yun)平臺作為醫(yi)(yi)(yi)療機(ji)構推進科(ke)(ke)研(yan)的(de)重(zhong)要助(zhu)手,則能提(ti)供(gong)多樣化(hua)的(de)影像(xiang)大數據科(ke)(ke)學分析(xi)能力,可大大加快放射組(zu)學等新技術(shu)在醫(yi)(yi)(yi)療行業的(de)研(yan)發與落地進程。

為幫助匯醫(yi)慧影優(you)化(hua)這一全周期AI醫(yi)學(xue)影像解決方(fang)案的(de)(de)性能,英(ying)特(te)(te)(te)爾不僅提(ti)供了集成有英(ying)特(te)(te)(te)爾?深度學(xue)習(xi)加速(英(ying)特(te)(te)(te)爾?DLBoost)技術的(de)(de)第二代英(ying)特(te)(te)(te)爾?至強?可擴展處理(li)器,用作方(fang)案的(de)(de)核心(xin)計算引擎(qing),還提(ti)供了OpenVINO?工具套件(jian)(jian)以及面向英(ying)特(te)(te)(te)爾?架構優(you)化(hua)的(de)(de)Python等軟(ruan)件(jian)(jian)優(you)化(hua)工具。得益于這些軟(ruan)硬件(jian)(jian)相互(hu)搭配、協作優(you)化(hua)帶來的(de)(de)整體加速優(you)勢,匯醫(yi)慧影Dr.TuringAI平臺(tai)在(zai)新冠肺(fei)炎篩查、乳腺癌(ai)檢測等影像分(fen)析(xi)場景(jing)中的(de)(de)推理(li)速度獲(huo)得了顯著提(ti)升。同(tong)時,放射組學(xue)分(fen)析(xi)方(fang)案在(zai)優(you)化(hua)后(hou)的(de)(de)Radcloud大數據(ju)智能分(fen)析(xi)云平臺(tai)的(de)(de)支持(chi)下,在(zai)處理(li)效率上也(ye)收獲(huo)了明顯的(de)(de)加速效果。


匯醫(yi)慧(hui)影(ying)全周期AI醫(yi)學影(ying)像解(jie)決方案實現(xian)的(de)應用優勢:

?在與新冠肺炎篩查相關的(de)(de)肺部CT影像(xiang)分析場景中,第二代(dai)英特爾?至(zhi)(zhi)強?可擴展(zhan)處理(li)器帶來的(de)(de)算力與OpenVINO?工具套(tao)件帶來的(de)(de)優化相配合,可令Dr.TuringAI平(ping)臺的(de)(de)平(ping)均推理(li)耗(hao)時縮短至(zhi)(zhi)原先的(de)(de)35%;

?在(zai)乳腺癌影像分析(xi)場景中,基(ji)于第二(er)代英特(te)爾(er)?至強?可擴展(zhan)處理(li)器(qi),及(ji)其集成(cheng)的英特(te)爾(er)?深度(du)學習加速(su)技術提(ti)供的INT8推(tui)理(li)加速(su),在(zai)Dr.TuringAI平(ping)臺(tai)上構(gou)建的檢測模(mo)型在(zai)采用OpenVINO?工(gong)具套件(jian)進行轉換和優化(hua)后,其推(tui)理(li)速(su)度(du)較原(yuan)始方(fang)案提(ti)升(sheng)高達8.24倍,且精確度(du)損(sun)失不到0.17%;

?通過使用面向英(ying)特爾?架構(gou)優化的(de)(de)Python,并結合第(di)二代英(ying)特爾?至強?可擴展處理器提(ti)(ti)供(gong)的(de)(de)算(suan)力(li)支持,放射組學(xue)分(fen)析(xi)方案在基于Radcloud大(da)數據智能分(fen)析(xi)云平臺(tai)的(de)(de)醫療(liao)科研平臺(tai)上的(de)(de)推理速度,實現了(le)多達2.08倍(bei)至2.12倍(bei)不等的(de)(de)提(ti)(ti)升。

新冠肺炎的突然爆發和大規(gui)模流行,對于中(zhong)國及全球醫療機構(gou)而言,是一(yi)個在速度和烈(lie)度上都堪稱(cheng)嚴峻的挑戰。

控制新(xin)冠(guan)疫情(qing)的(de)原則(ze),和(he)預防及(ji)控制其(qi)他傳染病(bing)基(ji)本(ben)一致(zhi),即遵循“三早原則(ze)”——早發現、早診斷、早治療(liao)。其(qi)中,“早發現”或者說“早診斷”是將被感染者從疑似人群中及(ji)時辨識出來,并(bing)盡早進(jin)行后續隔離治療(liao)的(de)關鍵步驟。如圖(tu)一所示,在實踐中,中國醫療(liao)機構普遍以核酸試劑檢(jian)測(圖(tu)一左)為主要診斷方式(shi)(shi),以肺部(bu)CT 影像(xiang)檢(jian)查(cha)(cha)(圖(tu)一右)為輔助方式(shi)(shi),來對新(xin)冠(guan)肺炎進(jin)行篩(shai)查(cha)(cha)診斷。

圖一 新冠(guan)肺炎(yan)篩(shai)查診斷方法圖示

核酸檢(jian)(jian)(jian)測雖有(you)便捷的(de)優勢,但其會受樣(yang)本(ben)(ben)病毒(du)(du)含量、病毒(du)(du)是(shi)否變(bian)異(yi)、病毒(du)(du)核酸是(shi)否有(you)效(xiao)提取(qu),以及樣(yang)本(ben)(ben)是(shi)否合理保存(cun)等因素的(de)影(ying)響,存(cun)在(zai)一(yi)定(ding)概率的(de)檢(jian)(jian)(jian)測結果誤判,即(ji)呈“假陰性”。肺(fei)(fei)部CT影(ying)像(xiang)檢(jian)(jian)(jian)查是(shi)通過(guo)分(fen)析肺(fei)(fei)部真(zhen)實影(ying)像(xiang)來判別患(huan)者(zhe)肺(fei)(fei)部是(shi)否出現病變(bian),因此在(zai)對早(zao)期新冠肺(fei)(fei)炎癥狀的(de)檢(jian)(jian)(jian)測敏感度(du)上,要優于(yu)核酸檢(jian)(jian)(jian)測。一(yi)項數據表明,在(zai)51例患(huan)者(zhe)的(de)檢(jian)(jian)(jian)測結果中,肺(fei)(fei)部CT影(ying)像(xiang)檢(jian)(jian)(jian)測對于(yu)新冠肺(fei)(fei)炎的(de)靈敏度(du)為98%,遠(yuan)高于(yu)核酸檢(jian)(jian)(jian)測(反(fan)(fan)轉錄(lu)-聚合酶鏈反(fan)(fan)應(ying)方法)71%的(de)靈敏度(du)。

不(bu)過(guo),肺(fei)部CT影(ying)像(xiang)檢查這一方法的(de)應用(yong)“門檻”,要遠(yuan)高(gao)于(yu)核酸(suan)檢測(ce),它不(bu)僅需要醫生具有(you)專業的(de)CT影(ying)像(xiang)分(fen)析能力,也(ye)需要對(dui)新冠(guan)肺(fei)炎征象有(you)敏銳的(de)臨床判斷力。例如,新冠(guan)肺(fei)炎的(de)典(dian)型(xing)征(zheng)象(xiang)之一——肺部磨玻璃(li)影,同時(shi)也是(shi)多(duo)種(zhong)肺炎、病原體(ti)感染的(de)重要征(zheng)象(xiang)。因此,醫生在分析(xi)傳統二維的(de)CT影像時(shi),往(wang)往(wang)需要反復比對(dui)判讀。遇到更復雜的(de)情(qing)(qing)況時(shi),可能還(huan)需進行多(duo)科(ke)室會診。在疫情(qing)(qing)出現爆(bao)發的(de)情(qing)(qing)況下(xia),這(zhe)種(zhong)應對(dui)方(fang)式顯然會造成疫情(qing)(qing)防(fang)控上(shang)的(de)延誤。

為破解這一難題(ti),讓肺部(bu)CT影(ying)(ying)像檢(jian)查(cha)在疫情防控中(zhong)發揮更(geng)及時、更(geng)重要(yao)的作用(yong),作為全球(qiu)醫學影(ying)(ying)像AI應用(yong)研發領跑者的匯醫慧影(ying)(ying),開(kai)始出(chu)動Dr.TuringAI平臺作為抗疫先鋒,來推動新冠(guan)肺炎的快速篩查(cha)。

軟硬協同優化提升新冠肺炎篩查速度


作為(wei)匯醫(yi)慧影(ying)全周期AI醫(yi)學影(ying)像解(jie)決方案(an)中專(zhuan)攻AI醫(yi)學影(ying)像輔(fu)助診(zhen)斷的(de)平臺(tai),Dr.TuringAI平臺(tai)可為(wei)醫(yi)院和患(huan)(huan)者提供“多病種AI輔(fu)助應用”及“結構(gou)化(hua)報告”兩大(da)主要功能(neng)(neng)。它不僅可提供10余(yu)種常見疾病的(de)AI輔(fu)助診(zhen)療能(neng)(neng)力,也(ye)能(neng)(neng)實現自動化(hua)病灶分割、檢測和測量,并輸出帶有**-RADS分級等信息(xi)的(de)AI結構(gou)化(hua)報告,在幫助醫(yi)院提升診(zhen)療效率之余(yu),也(ye)能(neng)(neng)助患(huan)(huan)者獲得更精準的(de)診(zhen)療方案(an)。

雖然Dr.TuringAI平(ping)臺(tai)已久(jiu)經考驗,但在面(mian)對(dui)新冠(guan)肺(fei)(fei)炎的(de)(de)篩(shai)查(cha)任務時,還是需要進行一些(xie)有針對(dui)性(xing)的(de)(de)優(you)化(hua)升(sheng)級。這些(xie)優(you)化(hua)升(sheng)級如圖二所示,包括:一方面(mian),平(ping)臺(tai)需要通過收集大量新冠(guan)肺(fei)(fei)炎數據,由專業醫(yi)生進行標注后(hou),再結合(he)(he)平(ping)臺(tai)內置(zhi)的(de)(de)深度學(xue)習算(suan)(suan)法(fa),實(shi)現對(dui)肺(fei)(fei)炎病灶區的(de)(de)精(jing)準(zhun)分割和(he)測量;另(ling)一方面(mian),平(ping)臺(tai)也(ye)需要結合(he)(he)InceptionV4、InceptionResNetV2等深度學(xue)習算(suan)(suan)法(fa)模型,將原(yuan)本二維的(de)(de)CT切片進行一系列的(de)(de)“三維”重構,更加清晰直觀地反(fan)映出病灶的(de)(de)位置(zhi)、尺寸、面(mian)積(ji)變化(hua)以危(wei)重程(cheng)度等量化(hua)數據,為醫(yi)生提供(gong)更全面(mian)的(de)(de)病理圖像分析,從(cong)而幫助他們更快、更準(zhun)確(que)地進行綜(zong)合(he)(he)研判。
圖二 基于匯醫慧影Dr.TuringAI平(ping)臺的新冠肺(fei)炎篩查

上述調(diao)整雖然更適用(yong)(yong)于新冠(guan)肺炎的(de)(de)(de)(de)(de)(de)CT篩(shai)查,但也會讓Dr.TuringAI平臺執行推(tui)理(li)等過程的(de)(de)(de)(de)(de)(de)計算量和(he)復雜度急劇(ju)增加。為了在(zai)這種情況下確保令人滿(man)意的(de)(de)(de)(de)(de)(de)推(tui)理(li)性能,匯醫慧影與英(ying)特爾一起(qi),在(zai)借助第二代(dai)英(ying)特爾?至(zhi)強?可擴展處理(li)器實現更強算力支持的(de)(de)(de)(de)(de)(de)同時(shi),還(huan)引(yin)入(ru)了OpenVINO?工具(ju)(ju)套件(jian),使用(yong)(yong)其(qi)內(nei)置的(de)(de)(de)(de)(de)(de)優(you)化工具(ju)(ju),將已有的(de)(de)(de)(de)(de)(de)、通(tong)過Pytorch深度學習(xi)框架構建的(de)(de)(de)(de)(de)(de)NestedU-Net和(he)HR-Net網絡模型(xing)轉換(huan)為可利用(yong)(yong)OpenVINO?工具(ju)(ju)套件(jian)加速的(de)(de)(de)(de)(de)(de)模型(xing),并(bing)使用(yong)(yong)該工具(ju)(ju)套件(jian)提供的(de)(de)(de)(de)(de)(de)推(tui)理(li)引(yin)擎對整個管道(dao)(pipeline)進行了更新。后續進行的(de)(de)(de)(de)(de)(de)基準測試如圖三所(suo)示(shi),相(xiang)比優(you)化前用(yong)(yong)時(shi)長達(da)(da)140.3秒,調(diao)優(you)后的(de)(de)(de)(de)(de)(de)每數據樣(yang)本(ben)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)推(tui)理(li)時(shi)長僅(jin)為48.47秒,平均推(tui)理(li)耗時(shi)縮短至(zhi)原(yuan)先的(de)(de)(de)(de)(de)(de)35%,或(huo)者說,其(qi)平均推(tui)理(li)性能提升高達(da)(da)2.89倍(bei)。

圖三 使用(yong)OpenVINO?工具套件(jian)對新冠肺炎CT檢(jian)測模型進(jin)行(xing)優化前后的效果對比

這(zhe)樣(yang)的(de)性能提升(sheng)成果,可令(ling)新冠肺(fei)炎CT影(ying)像(xiang)的(de)篩查(cha)速(su)度實現大幅(fu)提升(sheng)。而事實上,這(zhe)已經(jing)不是Dr.TuringAI平臺首次從英特(te)爾這(zhe)一(yi)軟一(yi)硬、協(xie)同優化的(de)組合中獲取如此強勁的(de)AI加速(su)支持(chi)了。此前匯醫(yi)慧影(ying)在該平臺上構建以ResNet50卷積網(wang)絡模(mo)(mo)(mo)型作為基(ji)礎網(wang)絡(Backbone)的(de)RetinaNet目標(biao)檢測模(mo)(mo)(mo)型,來對乳腺癌(ai)影(ying)像(xiang)實施模(mo)(mo)(mo)型訓(xun)練(lian)及推理時,就曾(ceng)使用過這(zhe)對構成英特(te)爾?至強?平臺AI加速(su)技術(shu)核心的(de)組合。

由(you)于(yu)OpenVINO?工具套件內置有多種(zhong)優化(hua)工具和(he)預訓練(lian)模(mo)型(xing)(xing),且能對已(yi)訓練(lian)好的模(mo)型(xing)(xing)進行壓縮和(he)加速等優化(hua),來(lai)提升模(mo)型(xing)(xing)推(tui)理速度,因而匯醫慧影當時的優化(hua)手段,如圖(tu)四所示,是先使用(yong)它優化(hua)用(yong)于(yu)乳腺癌(ai)檢測的FP32模(mo)型(xing)(xing),優化(hua)后(hou)的模(mo)型(xing)(xing)在推(tui)理速度上達到了原始(shi)模(mo)(mo)(mo)型(xing)的(de)3.02倍;繼(ji)而,匯(hui)醫慧影又借助(zhu)OpenVINO?工(gong)具套件(jian),將(jiang)(jiang)上述FP32模(mo)(mo)(mo)型(xing)轉換成(cheng)INT8模(mo)(mo)(mo)型(xing),在確(que)保(bao)模(mo)(mo)(mo)型(xing)精(jing)確(que)度(du)只受輕微影響的(de)情況下,啟用第二代英特(te)爾?至(zhi)強?可擴展處理(li)(li)器集成(cheng)的(de)英特(te)爾?深度(du)學(xue)習加速(su)技術對于(yu)INT8提供的(de)特(te)定加速(su)支持,將(jiang)(jiang)其(qi)推理(li)(li)速(su)度(du)進一步提升達初(chu)始(shi)模(mo)(mo)(mo)型(xing)的(de)8.24倍,且精(jing)度(du)損失還(huan)不到0.17%。



圖四 使用OpenVINO?工具套(tao)件對(dui)乳腺(xian)癌檢測模型(xing)進(jin)行優(you)化(hua)前后的效果對(dui)比(bi)

不(bu)論是對新冠肺炎CT影(ying)像(xiang)篩查的加速,還是對乳腺癌AI檢測模型的性(xing)能優化,它(ta)們的成功(gong)都足(zu)以(yi)證明(ming):第二代英特爾?至強?可擴展處理(li)器與(yu)OpenVINO?工(gong)具套件的引(yin)入(ru)和搭配,可以(yi)在醫學影(ying)像(xiang)分析場景中發揮出(chu)“1+1>2”的功(gong)效。它(ta)們也(ye)表明(ming),在眾多(duo)醫療機(ji)構(gou)既(ji)有的、基于CPU的IT基礎設施上(shang)部署和運行醫學影(ying)像(xiang)類的AI應用,不(bu)僅可行,而且高效。

打造全周期AI醫學影像解決方案


Dr.TuringAI平(ping)臺在新(xin)冠肺炎等(deng)(deng)疾病(bing)檢測,或者說輔助診(zhen)斷上(shang)的優異表(biao)現,是匯醫慧影與(yu)英(ying)特爾等(deng)(deng)合作伙伴一起(qi),通過協作創新(xin)助力醫療機構從信(xin)息化(hua)向智能(neng)化(hua)轉(zhuan)型的又一抹亮色。

這一(yi)轉(zhuan)型,也確(que)實至關重要。雖說(shuo)醫(yi)(yi)療(liao)信(xin)息化的(de)(de)(de)(de)全(quan)面(mian)鋪開,讓各類醫(yi)(yi)療(liao)設(she)備和醫(yi)(yi)用信(xin)息系統,尤其是醫(yi)(yi)學影(ying)像設(she)備的(de)(de)(de)(de)應(ying)用越來越普(pu)及(ji),使之成為了(le)各醫(yi)(yi)療(liao)機構、醫(yi)(yi)學科研部門(men)的(de)(de)(de)(de)重要助(zhu)手,甚至造就了(le)“臨床上(shang)有(you)(you)超過(guo)70%的(de)(de)(de)(de)診斷有(you)(you)賴于醫(yi)(yi)學影(ying)像提(ti)供支持”的(de)(de)(de)(de)重要成果,但僅有(you)(you)信(xin)息化策略推動的(de)(de)(de)(de)硬件設(she)施普(pu)及(ji),對提(ti)升醫(yi)(yi)療(liao)機構診療(liao)水平來說(shuo)還是遠遠不夠的(de)(de)(de)(de)。在大眾真實的(de)(de)(de)(de)就醫(yi)(yi)體(ti)驗中(zhong),常會發現(xian)在肺結節、乳腺(xian)癌、前列腺(xian)癌、骨折等(deng)一(yi)些(xie)醫(yi)(yi)療(liao)資源相(xiang)對緊張的(de)(de)(de)(de)病(bing)種診斷上(shang),長(chang)時間排隊等(deng)候、影(ying)像分析誤(wu)判的(de)(de)(de)(de)情況仍(reng)是屢(lv)見不鮮。

究其原因,是因為醫學影像(xiang)分析(xi)不(bu)僅需(xu)要設備就位,更需(xu)要使用這些設備的醫生能夠熟練掌握臨床(chuang)醫學、放射學、醫學影像(xiang)學等方面(mian)的(de)專業知識和(he)技能,也(ye)需要他們(men)能夠充分運用各種影像分析技術,對疾病進行輔助診斷。而有以(yi)上綜合能力的(de)醫生,即便在大醫院(yuan)也(ye)是相對缺乏的(de)。
圖五 多場景化部署的匯醫慧影AI醫學影像解決方案

而這(zhe)也(ye)正是(shi)眾多(duo)醫(yi)(yi)療(liao)(liao)機(ji)(ji)構在完成初步的(de)(de)信息化(hua)建設(she)之(zhi)后,就希望進(jin)一步借助AI、大(da)數據(ju)、云計算(suan)等新(xin)興技術(shu)手段(duan)來完 成智能化(hua)轉型的(de)(de)目的(de)(de)所(suo)在。如圖(tu)五(wu)所(suo)示,這(zhe)也(ye)是(shi)匯醫(yi)(yi)慧影(ying)以旗下Dr.TuringAI平(ping)臺(tai)、Novacloud智慧影(ying)像(xiang)云及Radcloud大(da)數據(ju)智能分析(xi)云平(ping)臺(tai)等領(ling)先產(chan)品(pin)為抓(zhua)手,通(tong)過公(gong)有(you)云、私有(you)云或AI一體機(ji)(ji)等多(duo)場景部署方(fang)式(shi),為醫(yi)(yi)療(liao)(liao)機(ji)(ji)構提(ti)供全周期(qi)、高性能和智能化(hua)AI醫(yi)(yi)學影(ying)像(xiang)解(jie)決(jue)方(fang)案的(de)(de)初衷(zhong)。

如(ru)果說(shuo)Dr.TuringAI平(ping)臺(tai)提供(gong)的(de)是高效、便捷的(de)前端(duan)醫學影(ying)(ying)像AI分析和(he)輔助(zhu)診(zhen)(zhen)斷(duan)能(neng)(neng)力,那么Novacloud智慧(hui)影(ying)(ying)像云擔(dan)當(dang)的(de)角色(se),就是為醫療(liao)機構和(he)患者提供(gong)基(ji)于(yu)云服務(wu)的(de)端(duan)到端(duan) AI互動能(neng)(neng)力。如(ru)圖(tu)六所示,在(zai)醫生(sheng)側(ce)(ce),結(jie)合Dr.TuringAI平(ping)臺(tai),影(ying)(ying)像云可提供(gong)多終(zhong)端(duan)AI閱片、遠程(cheng)會診(zhen)(zhen)、轉診(zhen)(zhen)等(deng)功能(neng)(neng);在(zai)患者側(ce)(ce),影(ying)(ying)像云能(neng)(neng)夠提供(gong)基(ji)于(yu)自然語言處(chu)理(NaturalLanguageProcessing,NLP)技術的(de)智能(neng)(neng)報告解讀、遠程(cheng)專家咨詢及多終(zhong)端(duan)影(ying)(ying)像閱覽(lan)等(deng)功能(neng)(neng);而對(dui)醫療(liao)機構來(lai)說(shuo),影(ying)(ying)像云不僅(jin)能(neng)(neng)對(dui)Radcloud大數據(ju)智能(neng)(neng)分析云平(ping)臺(tai)提供(gong)支持(chi),也可讓管理者以管理駕駛艙(cang)的(de)模式,對(dui)診(zhen)(zhen)療(liao)、科研進度獲得更直(zhi)觀的(de)了解,并支持(chi)其對(dui)相(xiang)關策略和(he)計(ji)劃進行調整。
圖(tu)六 打通全(quan)周期AI醫(yi)療影像(xiang)解決方案的Novacloud智慧(hui)影像(xiang)云

優化版Python改善醫療科研
工作效率


如(ru)前文所述,與Dr.TuringAI平臺(tai)、Novacloud智慧影像云并列為(wei)匯醫(yi)慧影全(quan)周期AI醫(yi)學影像解決方(fang)案(an)支柱的(de),還有Radcloud大數據智能分析云平臺(tai),它的(de)主要(yao)任務是承載醫(yi)療機構的(de)科研(yan)工作。

目前眾多醫療(liao)機(ji)構都在利用(yong)CT、MRI、PET等醫學(xue)影(ying)像,通(tong)過放(fang)射(she)(she)組(zu)(zu)(zu)學(xue)等新技(ji)術(shu)(shu)開展癌癥等惡性(xing)疾病(bing)的早期發(fa)現和防治。作為(wei)開發(fa)放(fang)射(she)(she)組(zu)(zu)(zu)學(xue)解(jie)決方案的領(ling)先(xian)企(qi)業,匯醫慧影(ying)就正以(yi)(yi)Radcloud大數據智能分析云平(ping)臺等產品(pin)為(wei)基礎(chu),為(wei)醫療(liao)機(ji)構提供“全周期”、“一(yi)鍵(jian)式”的影(ying)像大數據科(ke)學(xue)分析能力(li),以(yi)(yi)加速放(fang)射(she)(she)組(zu)(zu)(zu)學(xue)等新技(ji)術(shu)(shu)在醫療(liao)行業的科(ke)研和應用(yong)進程。

要(yao)進一步了解Radcloud大數據(ju)(ju)智(zhi)能(neng)分析云平臺(tai)在放(fang)射組學(xue)科(ke)研(yan)項(xiang)目(mu)中發揮(hui)的作用(yong),就要(yao)先了解什么是放(fang)射組學(xue)。簡而(er)言(yan)之(zhi),它(ta)就是通(tong)過將醫學(xue)影(ying)像轉換(huan)為可挖掘的高通(tong)量影(ying)像特(te)征數據(ju)(ju),并(bing)使用(yong)特(te)定(ding)方(fang)法(fa),篩選出最(zui)有(you)價值的影(ying)像組學(xue)特(te)征,進而(er)再(zai)通(tong)過AI模型訓練,建立起(qi)具有(you)診斷、預后或預測價值的模型,最(zui)終為精準(zhun)化、個體化診療提供有(you)效支持(chi)。


圖七(qi) 放射(she)組學基本分析流程(cheng)

如圖七所示,放射(she)組學(xue)的(de)基(ji)本(ben)流程(cheng)可分為(wei)數據收集、VOI分割(ge)、特(te)征提取(qu)(qu)、特(te)征選(xuan)擇、模(mo)型訓(xun)練以及模(mo)型評價及預測等(deng)步驟(zou)。為(wei)了更好地辨識醫學(xue)影(ying)像(xiang)中的(de)細節,平臺(tai)(tai)在特(te)征提取(qu)(qu)步驟(zou)中會盡可能地提取(qu)(qu)更多數據特(te)征,因此(ci)平臺(tai)(tai)可能會面對“維度(du)災難”等(deng)問(wen)題,即指在樣本(ben)量一定的(de)情況(kuang)下(xia),隨著(zhu)輸入維度(du)的(de)增(zeng)加,空間數據會變得更為(wei)稀疏,這會嚴重(zhong)影(ying)響模(mo)型的(de)預測效果,并大幅(fu)增(zeng)加平臺(tai)(tai)計算量,帶來推理效率的(de)下(xia)降。

為(wei)應對這(zhe)一(yi)問題,匯醫(yi)慧(hui)影與英(ying)特爾(er)一(yi)起,選(xuan)擇(ze)LASSOCV、PCA等(deng)特征(zheng)選(xuan)擇(ze)算(suan)(suan)法,來有效(xiao)預(yu)防科研平臺(tai)可(ke)能(neng)面臨的維(wei)度災難,并幫助平臺(tai)在(zai)壓縮(suo)數據的同時保(bao)持信息(xi)損(sun)失最小化。為(wei)提升這(zhe)些特征(zheng)選(xuan)擇(ze)算(suan)(suan)法的效(xiao)率,科研平臺(tai)不(bu)僅(jin)引入了第二代英(ying)特爾(er)?至強?可(ke)擴展處(chu)理器作為(wei)算(suan)(suan)力基石,還(huan)加持以面向英(ying)特爾(er)?架構優化的Python,來全面調優其運行效(xiao)率。

與(yu)原生版的Python相(xiang)比,面向(xiang)英特(te)爾?架(jia)構(gou)優化的Python內置最(zui)新的矢量化指(zhi)令(ling),支持更多(duo)元化的英特(te)爾?性能庫(如英特(te)(te)爾?MKL),同時也對(dui)重要的第三方AI知(zhi)識庫sklearn庫有著(zhu)良(liang)好(hao)的支持,使平臺特(te)(te)征選擇(ze)的執行(xing)效率獲得了顯(xian)著(zhu)提升。

算(suan)法優(you)化后的(de)(de)效果如圖(tu)八所示(shi),其(qi)左圖(tu)反映(ying)了(le)勾選(xuan)全(quan)部(bu)放射組(zu)學特(te)征,采用(yong)(yong)K-Fold10交叉驗證(zheng)的(de)(de)LASSOCV算(suan)法工作負載,采用(yong)(yong)面(mian)向(xiang)英(ying)特(te)爾(er)?架構優(you)化的(de)(de)Python后,其(qi)執行速度(du)是采用(yong)(yong)原生Python時(shi)的(de)(de)2.12倍;其(qi)右圖(tu)則反映(ying)了(le)勾選(xuan)全(quan)部(bu)放射組(zu)學特(te)征,采用(yong)(yong)K-Fold10交叉驗證(zheng)的(de)(de)LASSOCV+PCA算(suan)法工作負載,采用(yong)(yong)面(mian)向(xiang)英(ying)特(te)爾(er)?架構優(you)化的(de)(de)Python后,其(qi)執行速度(du)是采用(yong)(yong)原生Python時(shi)的(de)(de)2.08倍。


圖八 使用面向英特爾?架構優化的Python與使(shi)用原生(sheng)Python時的性能對比

基(ji)于(yu)英特爾?至強?平(ping)臺上述(shu)軟硬(ying)件融合輸出的(de)(de)AI加速(su)能力,匯(hui)醫慧影Radcloud大數據智能分(fen)析云平(ping)臺已被(bei)引入20余種疾(ji)病(bing)的(de)(de)研究,并成(cheng)功申報20余項(xiang)基(ji)金課題(ti)。更(geng)值得一提的(de)(de)是,平(ping)臺基(ji)于(yu)放射組學(xue)的(de)(de)AI方案也被(bei)用于(yu)新冠(guan)肺炎的(de)(de)精準(zhun)鑒別和診斷,并在實踐中獲得了用戶的(de)(de)良好(hao)反饋。

未來展望


隨著AI、大數據等新技術的(de)落地與持續創新,整個醫療行業正(zheng)在它們的(de)驅動下迎來巨變,尤其(qi)是通過引入(ru)創新的(de)AI醫學影像(xiang)解(jie)決方案(an),很多傳(chuan)統意義上的(de)疑難雜癥(zheng),乃(nai)至絕癥(zheng)正(zheng)在被一(yi)一(yi)攻克,以往會帶來巨大災難的(de)傳(chuan)染病,也(ye)開(kai)始在新技術、新平臺的(de)幫(bang)助下實現(xian)更為高效的(de)防控。

面(mian)向未來,英特爾還將(jiang)與(yu)匯醫慧影(ying)等合(he)作伙伴一起,推動更多領先產品技術、尤其是與(yu)AI和數據(ju)分析相關的(de)產品技術與(yu)醫療(liao)(liao)行業(ye)應用需求的(de)深度(du)融合(he),從而進一步(bu)加速醫療(liao)(liao)機(ji)構從信息(xi)化到智能(neng)化的(de)轉型,進而打造(zao)出更多樣(yang)化、也更有價值的(de)智慧醫療(liao)(liao)解決方案,造(zao)福(fu)全民健(jian)康事業(ye)。